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大小鼠SNP检测业务

业务简介

SNP( single nucleotide polymorphism,SNP),即单核苷酸多态性。常用于大小鼠遗传背景年度监测,检测大小鼠是否发生遗传突变或遗传污染、批量检测各类突变大小鼠。

 

药康优势

一站式服务:从引物设计到结果出具,可提供一站式服务。

经验丰富:自高通量检测平台成立以来,累计检测数据点达10余万个。

稳定的遗传检测panel:成功开发了13种近交系小鼠遗传检测及快速回交小鼠背景检测的SNP panel。

 

业务详情

SNP( single nucleotide polymorphism,SNP),即单核苷酸多态性,主要是指群体中变异频率大于1%的单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性,包括单碱基的转换、颠换、插入和缺失等。做为第三代遗传分子标记,SNP标记技术较其他遗传标记具有分布广泛、遗传稳定性好、具有代表性、二等位基因型、更容易实现高通量和自动化监测等遗传质量监控优势,而被越来越多的应用于农业、医学、生命科学等研究领域。

我司利用KASP技术,可实现对SNP的准确检测,可满足您以下需求:

1.大小鼠遗传背景年度监测:实验动物的年度遗传检测是评定和保证实验动物质量必不可少的检测措施之一,尤其是核心群,定期进行遗传背景监测十分必要。

2.检测大小鼠是否发生遗传突变或遗传污染:实验过程中若出现新的表型,或不确定是否配错鼠。

3.批量检测各类突变鼠,可实现对InDels(插入和缺失)进行准确分型。

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BALB/cJ背景品系遗传监测位点的KASP技术分型图(例)

基于已知SNP位点信息的高通量竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)技术,以高灵敏度的荧光检测为基础,可对各种基因组样本(包括复杂基因组DNA样本),针对指定的SNPs和InDels进行精准的双等位基因分型。该项技术原理上类似Taqman检测,准确度与金标准Taqman一致,与传统Taqman技术不同的是,它无需针对每个靶点合成特异的探针引物,其独特的ARM PCR原理,让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增。优化的PCR体系可满足不同位点高通量反应的需求,既有金标准的准确,又降低了实验成本,比Taqman还具有更好的位点适应性。

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C57BL/6J背景品系遗传监测位点的KASP技术分型图(例)

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BALB/cJ背景品系遗传监测位点的KASP技术分型图(例)

业务流程:

样品接受及位点信息确认

1d

DNA提取

2d

引物设计

1d - 5d

引物订购

3d - 15d

引物测试

15d

更换失败位点

16d - 20d

实验(包括实验、复核,报告出具等)

25d - 30d